Уточненная декларация

У нас на  предприятие была  выездная налоговая проверка, проверка за периоды с 01.01.2013 -31.12.15 г, Дата  начала Налоговой проверки с 09.01.2017 г. и дата окончания проверки 20.02.2018 г. В ходе этой проверки были обнаружены ошибки в 1 квартале 2014 г., в результате чего мы сдали уточненную корректировочную декларацию за этот квартал 21.10.2017 г. Эту корректировку мы сдали ко каналам связи и у нас имеется дата принятия 21.10.2017 г. и получения от налоговой с отметкой. После того как прошла налоговая проверка и было выписано решение в котором были указаны все ошибки и в том числе за 1 квартал 2014 года, после этого мы получаем требование с указанием недоимки и пени начисленные на эту  декларацию, мы стали разбираться с этим вопросом и выяснили, ранее поданная уточненная декларация за 1 квартал 2014 год была не учтена и не отражена 24.10. 2017 г., а ее отразили вручную по окончанию налоговой проверки 20.02.2018г . Налоговики сделали  пояснения. так как эта декларация сроком более 3-лет она подлежит камеральной проверки и ее проверяют в течении 3 месяцев и по этому ее поставили уже по окончанию налоговой проверки, но от даты принятия декларации у нас зависит начисления пеней, так у нас декларация к уплате. Подтвердите правильность действия налоговиков.